Preskoči na sadržaj
F

FlexS

Izdavač: BioSolveIT
Pregledano na viruse Windows Free
Verzija2.1.2
Izdavač BioSolveIT
Datum izlaska2. svi 2013.
Datum dodan2. svi 2013.
Os zahtjeviWindows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
ZahtjeviNone
Ukupno preuzimanja25
CijenaFree

Opis

FlexS predviđa konformaciju i orijentaciju jednog od liganada u odnosu na drugi. U FlexS-u se pretpostavlja da je referentni ligand krut, stoga ga treba dati u konformaciji koja je slična vezanom stanju. Algoritam superpozicije u FlexS-u zahtijeva samo malo ručne intervencije. Ovo znanje možete integrirati u izračune s FlexS-om ručnim izvođenjem pojedinačnih koraka. Stoga je FlexS dizajniran za interaktivni rad na parovima liganda kao i za virtualni pregled temeljen na ligandima. Dvije glavne primjene FlexS-a su superpozicioniranje liganda (npr. za CoMFA/QSAR) i virtualni pregled. Ako imate protein i malu molekulu koja se veže na njega (tzv. referentni ligand), ali nemate strukturu proteina, možete uzeti referentnu strukturu kao negativni otisak aktivnog mjesta. FlexS utvrđuje sličnost između testne i referentne strukture njihovim poravnavanjem. U virtualnom probiru imate referentni ligand i skup spojeva i zainteresirani ste za određivanje prioriteta spojeva za eksperimentalno testiranje.

Slični programi

Alternative

Više od ovog izdavača