Preskoči na sadržaj
CF

compsort for Mac

Izdavač: Paul A. Wilson
Mac Free
Verzija1.01
Izdavač Paul A. Wilson
Datum izlaska25. kol 2008.
Datum dodan11. kol 2004.
Os zahtjeviMacintosh, Mac OS X 10.3
ZahtjeviMac OS X 10.3
Ukupno preuzimanja29
CijenaFree

Opis

Alat za naredbeni redak za usporedbu podatkovnih datoteka odvojenih zarezima pomoću relativnih razlika za određivanje najsličnijih konformacija. Compsort uspoređuje podatkovne datoteke pomoću relativne razlike, izračunava rezultat sličnosti, razvrstava rezultate uzlaznim redoslijedom (niže vrijednosti predstavljaju veću sličnost), sprema X broj niskih rezultata.

Podatkovne datoteke koje proizvodi korisnik moraju biti tekstualne datoteke odvojene zarezima. Svaka datoteka predstavlja jedinstvenu molekulu. Svaki redak u datoteci predstavlja jedinstvenu konformaciju molekule. Prvi stupac u podatkovnoj datoteci mora biti oznaka jedinstvena za konformaciju koju predstavlja red. Ostali stupci su numerički deskriptori, kao što su mjerenja prostora udaljenosti.

Redovi se kombinatorno uspoređuju između datoteka. Oznake u usporedbi se spajaju i spremaju s rezultatima za skup redaka. Ovo pruža način da se identificiraju konformacije koje su proizvele dati rezultat sličnosti.

Budući rad uključuje:

dodavanje GUI sučelja

objavljivanje radova o mom algoritmu za modeliranje 3D farmakofora

Paralelna verzija koja koristi MPI

Slični programi

Alternative

Više od ovog izdavača